Jackson è stato morso e potrebbe essere stato Derek. Il padre di Allison le proibisce di stare con Scott ma i due si vedono in segreto. All'ospedale Lydia, finalmente sveglia, scompare dopo una terribile allucinazione nella doccia. Scott e Stiles cercano di rintracciarla usando il suo odore. Isaac, un teenager che subisce degli abusi da parte di suo padre, viene attaccato mentre sta lavorando nel cimitero di suo padre e Derek lo salva. Jackson comincia a sanguinare del liquido di colore nero e Derek è sorpreso nello scoprire che il suo corpo sta resistendo al morso. Scott viene attaccato da un altro lupo, mentre Lydia viene ritrovata. Derek costringe Scott ad assistere all'uccisione del lupo da parte di Gerard, nonostante il lupo protesti che non ha fatto del male a nessuno. Chris ricorda a suo padre del codice, ma Gerard risponde che il codice è stato infranto quando l'ultimo Alfa ha ucciso Kate.